En los ovarios, las trompas de Falopio y otras estructuras pélvicas pueden también crecer células similares a las de la membrana del útero (endometrio). Dicho estado se llama endometriosis. Los islotes de tejido endometriotico pueden sangrar durante el período menstrual o en otros momentos, y esa sangre puede formar quistes. La endometriosis puede causar cicatrices, adherencias , dolor o infertilidad.

Esa condición afecta principalmente a mujeres de edad reproductiva. En la mayoría de los casos esta enfermedad no constituye ningún problema para después de la menopausia, dado que ya han cesado los periodos menstruales.

La endometriosis puede ser tratada con hormonas. Cuando de estas no se obtiene el efecto deseado, los islotes de tejido endometriosico pueden ser extirpados con un instrumento llamado laparoscopio. De fallar este último procedimiento, posiblemente deba procederse a aun histerectomía.